在微生物的世界里，质粒作为关键的遗传元件，其在地球大陆地下微生物库中的作用却未明晰。研究人员分析 32 个地下井水的宏基因组样本，发现 4609 个非冗余移动遗传元件（MGEs），其中 14% 为质粒。该研究为了解地下水微生物组提供重要依据。

在研究和改造细菌时，基因组修饰面临难题，噬菌体编码的单链 DNA 退火蛋白（SSAPs）宿主范围窄。研究人员开展了对 227 种 SSAPs 文库的研究，发现其能在 6 种不同细菌中实现高效基因组编辑，有助于加速细菌遗传学研究。

为了最佳利用化石记录，研究者们包含了与阿尔法变形菌（alphaproteobacteria）相关的线粒体基因和与蓝藻（cyanobacteria）相关的叶绿体基因，借此利用早期复杂细胞的数据更好地估算事件发生的时间。 休根霍尔茨教授指出：“结果显示，至少有3条需氧谱系在GOE之前 ...