3月5日,中国海洋大学海洋生命学院教授汪岷团队基于序列比对和图论方法,开发了病毒分类新工具VITAP(Viral Taxonomic Assignment Pipeline)。该成果在《自然·通讯》)在线发表,为病毒组学和病毒生态学研究提供了重要工具。
该研究团队开发的VITAP通过结合序列比对与图论算法,不仅能对DNA及RNA病毒进行精准分类,还为每个分类单元提供了置信度评估,可对长度短至1000个碱基对的病毒基因组序列进行从门到属水平的高效分类,并大幅提升了病毒注释率。
在后续的分析测试中,该研究团队将VITAP方法成功应用于宏病毒组和病毒基因组的注释,结果显示VITAP在科级和属级的分类分析中不仅能保持超过90%的准确率、精度和召回率,还显示出了优于其他方法的注释率。
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