近期发表于《Cancer Cell》上的一项题名为“Conserved spatial subtypes and cellular neighborhoods ... 本研究整合了多个空间单细胞技术平台的数据,包括CosMx SMI(980-plex RNA panel)、MERSCOPE(500-plex RNA panel)、Xenium(5K RNA panel)、CODEX(56-plex ...
研究结论和讨论部分指出,APOE4 在小胶质细胞中的病理作用可能是通过损害自噬以及相关的 Aβ 斑块清除能力来实现的。这一发现揭示了 APOE4 与小胶质细胞自噬活性之间的直接联系,意味着可以通过诱导自噬的药物治疗来对抗 APOE4 的病理影响,例如雷帕霉素。这为 APOE4 相关的 AD 脑部病理治疗提供了新的思路和潜在的治疗方法,有望为 AD 患者带来新的希望。
为了解决这个问题,作者提出了CeLEry(Cell Location recovEry),这是一种监督深度学习算法 ... 同时也为恢复的位置提供不确定性估计。作者使用Visium、MERSCOPE、MERFISH和Xenium对来自脑癌组织的多个数据集进行了全面的基准评估,结果表明CeLEry可以可靠地利用scRNA ...