近期发表于《Cancer Cell》上的一项题名为“Conserved spatial subtypes and cellular neighborhoods ... 本研究整合了多个空间单细胞技术平台的数据，包括CosMx SMI（980-plex RNA panel）、MERSCOPE（500-plex RNA panel）、Xenium（5K RNA panel）、CODEX（56-plex ...

这项研究表明，这种名为“NiMe（Non-industrialized Microbiome Restore, 非工业化微生物组恢复）”的新饮食增强了罗伊氏乳杆菌在肠道中的短期持久性。 该 ...

研究结论和讨论部分指出，APOE4 在小胶质细胞中的病理作用可能是通过损害自噬以及相关的 Aβ 斑块清除能力来实现的。这一发现揭示了 APOE4 与小胶质细胞自噬活性之间的直接联系，意味着可以通过诱导自噬的药物治疗来对抗 APOE4 的病理影响，例如雷帕霉素。这为 APOE4 相关的 AD 脑部病理治疗提供了新的思路和潜在的治疗方法，有望为 AD 患者带来新的希望。

为了解决这个问题，作者提出了CeLEry（Cell Location recovEry），这是一种监督深度学习算法 ... 同时也为恢复的位置提供不确定性估计。作者使用Visium、MERSCOPE、MERFISH和Xenium对来自脑癌组织的多个数据集进行了全面的基准评估，结果表明CeLEry可以可靠地利用scRNA ...

《Genome Biology》编辑推荐：空间组学技术虽能揭示组织微环境异质性，但缺乏系统分析工具。中科院上海营养与健康研究所 ...