研究人员采用了多种关键技术方法。首先，从癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合数据库（GEO）获取数据，进行生物信息学分析，研究 CPA4 的表达情况。同时，收集 116 例子宫内膜癌患者的石蜡包埋标本及 15 例正常对照样本，通过免疫组化实验验证 CPA4 的表达。此外，构建蛋白 - 蛋白相互作用（PPI）网络、进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析、基因集富集分析 ...

研究人员运用了多种关键技术方法。他们从公共数据库（如 TCGA-KIRC、GEO）获取数据，研究 FBXO21 在 ccRCC 中的表达情况；通过组织样本采集和细胞培养，获取患者组织样本和细胞系；利用 RT-qPCR、免疫组化、焦磷酸测序等技术检测基因表达、蛋白表达和 DNA 甲基化水平；借助细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭实验以及动物实验，探究 FBXO21 对 ccRCC ...

Methods: Clinical data on patients with glioma were obtained from The Cancer Genome Atlas (TCGA), the Chinese Glioma Genome Atlas (CGGA), the Gene Expression Omnibus (GEO), and the Rembrandt and ...

CFEA, Cell-Free Epigenome Atlas; TCGA, the Cancer Genome Atlas; GEO, Gene Expression Omnibus; LUAD, lung adenocarcinoma. Metilene (v0.2-8) (Juhling et al., 2016) was used to call differentially ...

You can create a release to package software, along with release notes and links to binary files, for other people to use. Learn more about releases in our docs.

Anish M.S. Shrestha^[De La Salle University, Manila, Philippines, [email protected]] ## II. Downloading the TCGA gene expression data Create a function for downloading TCGA gene expression ...

然而，FASM 相关基因特征在肝细胞癌 （HCC） 中的分子特征、生理功能和临床预后价值仍然难以捉摸。 利用基因表达综合数据库 （GEO） 、癌症基因组图谱 （TCGA） 和国际癌症基因组联盟 （ICGC） 数据库获取 HCC 患者的转录组数据和临床信息。ConsensusClusterPlus 用于 ...

GEO's Q4 revenue of $607.7M beat estimates, but EPS fell short due to higher expenses. FY25 outlook: EPS of $0.74-$0.88, revenue expected around $2.5B, and adjusted EBITDA of $460M-$485M. Every ...