对于与小分子(63.3% 对比 50.4% 和 50.5%)、核苷酸(50.5% 对比 35.2% 和 34.0%)和金属(77.5% 对比 36.0% 和 40.6%)相互作用的残基,LigandMPNN 在天然主链序列恢复方面明显优于 Rosetta 和 ProteinMPNN。 LigandMPNN 不仅能生成序列,还能生成侧链构象,以便详细评估结合相互作用。
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